Отверстие в радиаторе, из-за которого разгерметизировалась система терморегулирования «Прогресса», оказалось в разы больше, чем было при аналогичном повреждении у «Союза МС-22». По данным «Роскосмоса», его диаметр — примерно 12 миллиметров. Ранее гендиректор «Роскосмоса» Юрий Борисов сообщил, что отверстие от микрометеорита в «Союзе» не превышает по размерам 0,8 миллиметра.
В госкорпорации подчеркнули, что РКК «Энергия» проанализировала историю замечаний к системе терморегулирования за последние 15 лет, чтобы исключить версию брака. По предварительным данным компании, «Прогресс МС-21», как и ранее «Союз МС-22», подвергся внешнему воздействию. Такие выводы сделаны на основе снимков, которые показывают изменения на внешней поверхности корабля, в том числе на радиаторе приборно-агрегатного отсека и панелях солнечных батарей.